MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 46268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000909	TTA	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000909	A	6	6	38	43	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000909	TTTA	2	8	67	74	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000909	AATTT	2	10	84	93	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000909	ATT	2	6	140	145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000909	ATTA	2	8	165	172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000909	GTAA	2	8	174	181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000909	TAT	2	6	244	249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000909	GAAA	2	8	251	258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000909	TAT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000909	AGT	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000909	TGA	2	6	343	348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000909	TAT	2	6	353	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000909	GGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000909	ATTA	2	8	444	451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000909	TGA	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000909	AATAG	2	10	698	707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000909	T	6	6	762	767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000909	AGA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000909	GAA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000909	AGC	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_000909	TCA	2	6	1056	1061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000909	TTG	2	6	1119	1124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000909	AGT	2	6	1239	1244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000909	ATA	3	9	1311	1319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000909	CTT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000909	TTAAA	2	10	1334	1343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000909	CCT	2	6	1376	1381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_000909	T	7	7	1387	1393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000909	ACA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000909	ATA	3	9	1591	1599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000909	CTT	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_000909	TTAAA	2	10	1614	1623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000909	ATT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000909	ACC	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_000909	TTC	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_000909	AAT	2	6	1716	1721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000909	T	6	6	1786	1791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000909	C	6	6	1820	1825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_000909	A	6	6	1872	1877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000909	A	6	6	1940	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000909	A	6	6	2008	2013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000909	ATT	2	6	2083	2088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000909	TTA	2	6	2096	2101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000909	TTA	2	6	2135	2140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000909	TTA	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000909	AGA	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000909	TAAAA	2	10	2196	2205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000909	TCAA	2	8	2346	2353	50 %	25 %	0 %	25 %	15668173
50	NC_000909	AT	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	15668173
51	NC_000909	TC	3	6	2466	2471	0 %	50 %	0 %	50 %	15668173
52	NC_000909	CT	3	6	2483	2488	0 %	50 %	0 %	50 %	15668173
53	NC_000909	AC	3	6	2502	2507	50 %	0 %	0 %	50 %	15668173
54	NC_000909	GCT	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15668173
55	NC_000909	TGA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668173
56	NC_000909	TTG	2	6	2595	2600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668173
57	NC_000909	TCA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668173
58	NC_000909	TCC	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668173
59	NC_000909	TTAA	2	8	2688	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	15668173
60	NC_000909	CTT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668173
61	NC_000909	AAT	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
62	NC_000909	ATT	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668173
63	NC_000909	T	7	7	2881	2887	0 %	100 %	0 %	0 %	15668173
64	NC_000909	TCAA	2	8	3030	3037	50 %	25 %	0 %	25 %	15668173
65	NC_000909	ATA	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
66	NC_000909	AAT	2	6	3083	3088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
67	NC_000909	ATC	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668173
68	NC_000909	CT	3	6	3143	3148	0 %	50 %	0 %	50 %	15668173
69	NC_000909	AGT	2	6	3175	3180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668173
70	NC_000909	TC	3	6	3344	3349	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
71	NC_000909	TCA	2	6	3413	3418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668174
72	NC_000909	TCT	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668174
73	NC_000909	TCA	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668174
74	NC_000909	TTTAC	2	10	3518	3527	20 %	60 %	0 %	20 %	15668174
75	NC_000909	CT	3	6	3608	3613	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
76	NC_000909	ATA	2	6	3631	3636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
77	NC_000909	AT	3	6	3647	3652	50 %	50 %	0 %	0 %	15668174
78	NC_000909	CTTT	2	8	3677	3684	0 %	75 %	0 %	25 %	15668174
79	NC_000909	CA	3	6	3687	3692	50 %	0 %	0 %	50 %	15668174
80	NC_000909	ATG	2	6	3724	3729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668174
81	NC_000909	TAA	2	6	3844	3849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
82	NC_000909	CT	3	6	3850	3855	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
83	NC_000909	CTT	3	9	3915	3923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668174
84	NC_000909	TA	3	6	3933	3938	50 %	50 %	0 %	0 %	15668174
85	NC_000909	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
86	NC_000909	CT	3	6	3958	3963	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
87	NC_000909	ACG	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668174
88	NC_000909	ATT	2	6	4098	4103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000909	GTA	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000909	T	6	6	4146	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000909	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000909	GGT	2	6	4193	4198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000909	TTAA	2	8	4252	4259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000909	TTGT	2	8	4273	4280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000909	ATTG	2	8	4287	4294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000909	AT	3	6	4296	4301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000909	TTG	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000909	ATT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000909	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000909	ATTAT	2	10	4448	4457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000909	GCT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_000909	AAACA	2	10	4470	4479	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_000909	CTAT	2	8	4488	4495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000909	TTTAA	2	10	4571	4580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000909	AT	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000909	TG	3	6	4685	4690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000909	GAT	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000909	T	6	6	4703	4708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000909	T	6	6	4730	4735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000909	TA	3	6	4747	4752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000909	ATT	2	6	4793	4798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000909	ATA	2	6	4803	4808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000909	TTTA	2	8	4816	4823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000909	TA	3	6	4822	4827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000909	TCA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_000909	ATTT	2	8	4874	4881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000909	GTT	2	6	4965	4970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668175
118	NC_000909	GTT	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668175
119	NC_000909	AAT	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
120	NC_000909	AAT	2	6	5039	5044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
121	NC_000909	ATTT	2	8	5067	5074	25 %	75 %	0 %	0 %	15668175
122	NC_000909	A	6	6	5139	5144	100 %	0 %	0 %	0 %	15668175
123	NC_000909	AAT	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
124	NC_000909	A	6	6	5181	5186	100 %	0 %	0 %	0 %	15668175
125	NC_000909	GAA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668175
126	NC_000909	T	6	6	5271	5276	0 %	100 %	0 %	0 %	15668175
127	NC_000909	ATC	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668175
128	NC_000909	A	6	6	5324	5329	100 %	0 %	0 %	0 %	15668175
129	NC_000909	AGA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668175
130	NC_000909	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668176
131	NC_000909	GTT	2	6	5471	5476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668176
132	NC_000909	TTA	2	6	5492	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668176
133	NC_000909	AGATA	2	10	5581	5590	60 %	20 %	20 %	0 %	15668176
134	NC_000909	GTT	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668176
135	NC_000909	CTGGAA	2	12	5742	5753	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15668176
136	NC_000909	ATAA	2	8	5801	5808	75 %	25 %	0 %	0 %	15668176
137	NC_000909	ATA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
138	NC_000909	TG	3	6	5844	5849	0 %	50 %	50 %	0 %	15668176
139	NC_000909	ATA	2	6	5870	5875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
140	NC_000909	A	7	7	5887	5893	100 %	0 %	0 %	0 %	15668176
141	NC_000909	AAGG	2	8	5900	5907	50 %	0 %	50 %	0 %	15668176
142	NC_000909	TAA	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
143	NC_000909	GGA	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668176
144	NC_000909	A	6	6	6035	6040	100 %	0 %	0 %	0 %	15668176
145	NC_000909	A	6	6	6047	6052	100 %	0 %	0 %	0 %	15668176
146	NC_000909	CTA	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668176
147	NC_000909	GTG	2	6	6131	6136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668177
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